Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB5Q9Y5E4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHB5Q9Y5E4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHB5Q9Y5E4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms