Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTDP1Q9Y5B0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTDP1Q9Y5B0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDP1Q9Y5B0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms