Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC47.78■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC47.77■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC47.76■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.73■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC47.7■■■■■ 5.23
DCAF1Q9Y4B6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC47.69■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.64■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.63■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.22
DCAF1Q9Y4B6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
DCAF1Q9Y4B6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC47.52■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
DCAF1Q9Y4B6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC47.49■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms