Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
RAD54L2Q9Y4B4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
RAD54L2Q9Y4B4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RAD54L2Q9Y4B4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.21
RAD54L2Q9Y4B4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
RAD54L2Q9Y4B4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms