Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIT1Q9Y3P8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIT1Q9Y3P8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIT1Q9Y3P8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIT1Q9Y3P8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIT1Q9Y3P8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIT1Q9Y3P8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIT1Q9Y3P8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIT1Q9Y3P8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIT1Q9Y3P8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIT1Q9Y3P8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms