Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX24Q9Y343 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX24Q9Y343 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms