Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML1Q9UN30 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms