Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM8Q9UJA3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCM8Q9UJA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM8Q9UJA3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms