Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IRD1Q9UHL9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IRD1Q9UHL9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IRD1Q9UHL9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms