Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SRRDQ9UH36 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRRDQ9UH36 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SRRDQ9UH36 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms