Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCDNQ9UBB6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCDNQ9UBB6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCDNQ9UBB6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164 ms