Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR35Q9P2L0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR35Q9P2L0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR35Q9P2L0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR35Q9P2L0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR35Q9P2L0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR35Q9P2L0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR35Q9P2L0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR35Q9P2L0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR35Q9P2L0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms