Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDP2Q9P2J9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP2Q9P2J9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP2Q9P2J9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms