Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMSAP3Q9P1Y5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMSAP3Q9P1Y5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMSAP3Q9P1Y5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMSAP3Q9P1Y5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMSAP3Q9P1Y5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms