Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR3BQ9P1U1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3BQ9P1U1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms