Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP1Q9P0J1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms