Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS2Q9NYR9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS2Q9NYR9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS2Q9NYR9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms