Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAH9Q9NYC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAH9Q9NYC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms