Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD5Q9NXV2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD5Q9NXV2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD5Q9NXV2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms