Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCF3Q9NUQ8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF3Q9NUQ8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF3Q9NUQ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms