Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNB1IP1Q9NPC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNB1IP1Q9NPC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms