Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARS2Q9NP81 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SARS2Q9NP81 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms