Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD90

NEUROD4, Neurogenic differentiation factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD4Q9HD90 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD4Q9HD90 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD4Q9HD90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms