Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf88Q9H8K7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C10orf88Q9H8K7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf88Q9H8K7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms