Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms