Protein–RNA interactions for Protein: Q9H598

SLC32A1, Vesicular inhibitory amino acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC32A1Q9H598 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC32A1Q9H598 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC32A1Q9H598 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC32A1Q9H598 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms