Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SENP3Q9H4L4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SENP3Q9H4L4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SENP3Q9H4L4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SENP3Q9H4L4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms