Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCX3BQ9H321 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3BQ9H321 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms