Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC113Q9H0I3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC113Q9H0I3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC113Q9H0I3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms