Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms