Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL4Q9BYD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL4Q9BYD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms