Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CECR2Q9BXF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CECR2Q9BXF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
CECR2Q9BXF3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
CECR2Q9BXF3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CECR2Q9BXF3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms