Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP4Q9BWG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms