Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED9Q9BVK6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms