Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THUMPD3Q9BV44 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THUMPD3Q9BV44 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD3Q9BV44 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms