Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP6Q9BRS8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP6Q9BRS8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LARP6Q9BRS8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms