Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF4Q9BQW3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF4Q9BQW3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms