Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SGIP1Q9BQI5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SGIP1Q9BQI5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SGIP1Q9BQI5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SGIP1Q9BQI5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms