Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED2Q99967 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms