Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRRT1Q99946 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms