Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD5Q99717 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD5Q99717 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms