Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC6Q96SB8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC6Q96SB8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC6Q96SB8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC6Q96SB8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms