Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H4Q96RI1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H4Q96RI1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms