Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms