Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACAP3Q96P50 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ACAP3Q96P50 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACAP3Q96P50 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms