Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPRD1AQ96P16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1AQ96P16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1AQ96P16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms