Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD6Q96NK8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD6Q96NK8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD6Q96NK8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD6Q96NK8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms