Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF560Q96MR9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF560Q96MR9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF560Q96MR9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF560Q96MR9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms