Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRRC1Q96M27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRRC1Q96M27 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRC1Q96M27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms