Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNBD2Q96M20 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD2Q96M20 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms