Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRR1Q96L50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRR1Q96L50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms